История мальчика-сироты Джонатана, который переезжает в Лейпциг и идет в новую школу. Он быстро обретает новых друзей, которые показывают ему свое секретное место — старый вагон, где они проводят свободное время. Однажды ребята обнаруживают в вагоне сценарий старой пьесы под названием «Летающий класс». Ребята решают поставить по пьесе спектакль к Рождеству. Но школьный учитель Юстас запрещает детям ставить эту пьесу.
Двенадцатилетний Дэнни живет вместе с матерью и ее новым мужем Риком Барнсом, редко имея возможность видеть своего родного отца Фрэнка. У мальчика не складываются отношения с отчимом, который кажется ему подозрительным типом. Однажды предчувствия Дэнни насчет Рика оправдываются. Мальчик тайно пробрался в автомобиль Барнса и стал очевидцем его второй жизни. Прямо на глазах Дэнни Рик убивает своего подельника. Мальчик бежит в полицию, но его рассказам никто не верит. Тогда Дэнни понимает, что единственный человек, который мог ему помочь, это его отец. За роль в фильме «Скрытая угроза» Джона Траволту номинировали на антипремию «Золотая малина» как худшего актера.