Фильм снят по реальным событиям, вызвавшим огромный резонанс в обществе, случившимся в Москве 26 декабря 1980 года и ставшими известными как «Убийство на Ждановской». Офицер КГБ возвращается поздно вечером домой на метро. На конечной станции «Ждановская» его задерживают три милиционера, которые, находясь в состоянии алкогольного опьянения, сильно избивают офицера. Последствия содеянного выливаются в жестокое убийство. Расследованием этого преступления, вызвавшего большой скандал, занимается следователь Глеб Ярин. Ему невольно приходится оказаться между двух огней, в самом эпицентре непримиримого противостояния двух систем — МВД и КГБ. Одни хотят наказать виновных, другие — замять произошедшее и оправдать преступников.
Майор милиции Гартс Рандерс приехал в гости к другу Юрису, живущему в деревне. Вечером того же дня Юриса находят мертвым в погребе собственного дома. Все, кроме Гартса посчитали, что произошел несчастный случай. Однако у опытного милиционера есть повод подозревать, что случилось убийство. Майор Рандерс начинает вести свое расследование, собирая улики и опрашивая потенциальных подозреваемых. «Малиновое вино» — советский детектив по мотивам повести Виктора Лагздиньша «Ночь на хуторе Межажи».