Люди в черном из тайной организации на страже покоя и безопасности Земли уже не раз защищали нас от нападения отбросов Вселенной. На этот раз самая большая опасность для мирового сообщества, которой агентам предстоит противостоять, — шпион в их рядах.
Бывший агент спецназа Неро переехал в небольшой городок рядом с океаном, чтобы спокойной вырастить своего сына, оставив за спиной бурное прошлое. Однажды ночью герою звонят по телефону и сообщают, что его сын похищен. Чтобы спасти его, бывшему спецназовцу необходимо выполнить приказ — убрать трех влиятельных преступников. Подобраться к этим целям практически невозможно, но у героя нет иного выхода, кроме как рисковать своей жизнью ради спасения ребенка.
Образцовый отец и хирург Пол Кериси (Брюс Уиллис) превращается в неостановимую машину-убийцу после того, как преступная группировка врывается в его дом, убивает жену и насилует дочь. Не надеясь на силы полиции, герой решает отомстить бандитам самостоятельно.