Корпорация «Мистерия» распадается из-за разногласий, возникших внутри команды. Все расходятся по разным направлениям, лишь Скуби-Ду со своим лучшим другом Шегги — не разлей вода. Они продолжают объедаться, веселиться и бояться всего вместе. Однажды Скуби-Ду и Шегги получают приглашение на Зловещий остров, где Эмиль Мондавариус обещает им горы вкусностей и развлечений. Поддавшись искушению, они собирают чемоданы и едут туда, но уже в аэропорту выясняется, что такие приглашения получили и Фред, Дафна и Велма. Эмиль Мондавариус зачем-то собрал Корпорацию «Мистерия» вместе.
Фред, Дафна, Вилма, Шэгги и конечно же Скуби-Ду вновь собираются в своей корпорации «Тайна», чтобы спасти город Кулсвиль от наводнения монстров. Неизвестный злодей, до поры до времени предпочитающий действовать инкогнито, решает затерроризировать город, наводнив его приведениями и монстрами. Для этого он создал специальную машину, генерирующую всяческую нечисть. Несмотря на то, что Скуби-Ду и компания сами до ужаса бояться приведений, они, преодолев свои страхи, бросаются в бой с монстрами! «Скуби-Ду 2: Монстры на свободе» — сиквел фильма «Скуби-Ду», созданного по одноименному мультсериалу.
Мамбл успел вырасти и даже обзавелся потомством. Загвоздка только в том, что его сын, независимый и слегка нагловатый Эрик, не хочет учиться танцевать. Эрик хочет большего — он стремится летать. Проблема отцов и детей и разница в интересах грозят перерасти в неразрешимый конфликт, однако Мамбл и Эрик вовремя понимают, что общего у них гораздо больше.