В сиквеле знаменитого фильма маленькие шпионы Кармен и Джуни Кортез (Алекса Вега и Дэрил Сабара) попадают на остров, которого нет на карте, и знакомятся с сумасшедшим ученым Ромеро (Стив Бушеми). Ромеро как будто решил повторить опыты доктора из «Острова доктора Моро» и населил остров странными животными. Пока твари пытаются съесть детей, родители Кортезы (Антонио Бандерас и Карла Гуджино) едут их спасать. В фильме «Дети шпионов 2» дело осложняется тем, что у молодого поколения появились конкуренты, тоже дети шпионов.
Юные агенты Джуни и Кармен Кортез отправляются на выполнение нового задания. На этот раз их ждет путешествие по виртуальному миру 3D-видеоигры, разработанной для того, чтобы населяющие ее существа явились в реальный мир. Кармен попадается в сети компьютерной игры, созданной зловещим Мастером Игрушек, и теперь Джуни должен спасти старшую сестру, а заодно и весь мир. Конечно, не без помощи родителей.
Прошло восемь лет с тех пор, как на экранах появились первые «Плохие парни», ставшие одним из самых кассовых фильмов, и режиссер Майкл Бэй «дозрел» до фильма-продолжения, снятого, естественного, с теми персонажами-актерами. Двое полицейских-напарников, Маркус Барнетт (Мартин Лоуренс) и Майк Лоури (Уилл Смит), отчаянно борются с преступностью в Майями, особенно наркодилерами.